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Some issues about head motion analysis in new-edition DPARSF

Submitted by wleewell on
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严老师好！关于新版DPARSF的一点不解，望回复。
1. Polynomial trend:
     1). if input 2，为linear trend+quadratic trend，quadratic trend是什么意义？
     2). if input 3，为linear trend+quadratic trend+cubic trend，cubic trend是什么意义？

2. Rigid-body 6、Friston 24、Voxel-specific 3、Voxel-specific 12 几种head-motion regressor有什么特点，您更推荐哪一种？
选择Head motion scrubbing regressors，是否推荐将bad time series也进行回归?

rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢？

Submitted by flyinghonghong on
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各位老师好：
     我已经用rest处理得到了配对t检验的t-map文件，格式是”.nii”，然后用Slice View可以读取，也可以看cluster。但是我想看每个cluster里面除了peak点以外的t值比较大的点的坐标和t值，请问要怎么才可以得到这样的t值和坐标的table呢？？？？

DPARSFA 出错

Submitted by yubing on
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Matlab 2012a
Win2008 64bit
REST 1.8
DPARSFA 2.2

选项及操作内容见附件，我没有处理被试的T1图像，不知道在DPARSFA 中应该如何处理设置

Matlab 出错信息如下，多谢指教，谢谢！

Index exceeds matrix dimensions.

Error in y_Normalize_WriteToMNI_DARTEL (line 47)

各位老师，菜鸟请教一个功能连接图的问题

Submitted by lxf3 on
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       本人想做一个关于耳鸣治疗前后的FC改变的图。根据文献（Maudoux, A., P. Lefebvre, et al. (2012). "Auditory resting-state network connectivity in tinnitus: a functional MRI study." PLoS One 7(5): e36222.）的23个ROI进行FC计算，得到相应的*ResultCorr.txt结果，使用brainnet工具可以生成单个对象的功能连接线图。请问如何得到治疗前后组的*ResultCorr以及经过配对T检验的*ResultCorr？？以下是单个对象的线图

有关xjview

Submitted by fish on
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尊敬的各位老师：
       我把网上下的xjview的软件包解压到matlab的toolbox的文件夹下，可以在rest的软件打开report，但是在matlab的command的窗口中却不能打开，跳出如下图，请老师看看具体原因是什么啊？

补充一个校正问题

Submitted by chengjinming861013 on
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严老师：
   用rest1.8 sliceviewer中的一个校正问题。
我用alphasim校正（cluster size大于228，rmm=5），正负两个cluster有边相连，正cluster2021个voxels，而负的只有28个voxels也被保留下来了，而且归到正的cluster里了。请问这种情况是正常的吗，还是需要去掉那28个负的体素？

     祝好

使用rest1.8时候出现的一些问题

Submitted by chengjinming861013 on
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严老师：
   您好，我在使用rest1.8 sliceviewer时经常出现一些问题，想向您咨询一下。
1. 在服务器上用小键盘设定p值时经常出现乱码，而用大键盘时正常。
2. 校正后和校正前自动生成的Color bar是完全一样的，个人认为校正后的color bar 的top值和bottom值应该随着校正而改变。
3. color bar中两个色块中的整数代表的是上一个色块还是下一个色块，特别是map中的color值都是整数的时候，比如overlap，我发现有时候代表上一个色块，有时候代表下一个下一个色块。
     祝好

关于时间点time point 的填写问题

Submitted by huangyan on
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各位老师你们好，我是一名数据处理的新手，在预处理数据进行到detrend 这一步时想用dparsf软件处理，（因为时间点的问题前面都是只能用spm处理，在这一步spm总是报错）；当我把输入数据到dparsf，出现以下提示：
如果使用spm,则报错以下内容：

z标准化的方法

Submitted by Red Stone on
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各位老师好：

从文献中看到，做完ICA之后，如果想做T-test，就得把ICA得到的成分做个z标准化，我想请问一下，这个z标准化可以用什么软件实现？

GIFT的utilities里面有一项是Z-shift，用它可以实现吗？我看manual上是这么说的：

“Z-shift is used to center the image distribution to zero based on the peak of the distribution.”

这句话是什么意思？

还望各位老师能为我解惑，谢谢！

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