Discuss

求助,dicom文件整理时出错

Submitted by cancas on
Forums

老师好,我是一名新手,很多东西都在摸索中,向各位老师学习。
我在用rest dicom sorter 整理时出现报错,这要怎么解决呢???还有我的rest dicom sorter 不能显示如教学视频中的 add  recursively all sub-folders of a directory这些选项

Warning: Directory "D:\matlab7.0\work" already exists.
> In mkdir at 116

请问如何逐切片逐时间点提取时间序列

Submitted by taobao2010 on
Forums
各位老师好:
      我在rest软件包中找到提取时间序列的程序(rest_ExtractROITC.m),发现程序是直接在一个时间点上取得均值作为当前时间点的值,即110个时间点,时间序列的长度即为110。如果我想按照逐层再逐时间点提取,即假设每个时间点61层(Z轴),共110个时间点,最后生成61×110长度的时间序列,应该如何做呢?谢谢

报结果

Submitted by yangshuo on
Forums
 老师你好,请问我用rest sliceviewer 的CLreporter报结果,用的Alphasim 校正,6平滑,p<0.01,应该是cluster size 40,rmm 5吧?那我的结果里面凡是小于40个cluster size 的脑区都不能报了吧?
  这里附上一个clusters
Number of voxels: 271
Peak MNI coordinate: -3 -90  30
Peak MNI coordinate region:  // Left Cerebrum // Occipital Lobe // Cuneus // Gray Matter // brodmann area 19 // Cuneus_L (aal)

multi-label images 能在一个MASK里定义的ROI有上限吧?

Submitted by yubing on
Forums
‘我今天用 AAL .nii  作为 REST 中“ multi-label images in one mask'" 的 mask 文件,以提取AAL脑区的时间序列
但是出错了,似乎是由于 定义的ROI 数超过了 软件的限制,具体出错信息附后。麻烦指教,多谢!

REST 1.7, Matlab 2011b, WINDOWS XP 

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

AAL_116或90 功能连接

Submitted by wleewell on
Forums
经常看到基于AAL-116或90模板分区做全脑功能连接的文献,相关操作问题想请教下老师们。
 
1、 首先要算出这些区域两两之间的相关值,在DPARSF中做是否合适?
2、 DPARSF得出那么多z值后,进行单样本及双样本t检验,可能可以在SPSS下做,但是否在Matlab下做是否更简单呢,相关程序是否可以教一下呢,或者还有其他办法吗?

请教Rest中Cl. Report功能报错

Submitted by taobao2010 on
Forums

各位老师好:
      我在Rest中使用BA模板选择了BA20和40两个区,且在Cluster Size中设置了rmm=5,此时我想看看Report报告中包含哪些区域信息,但是点击以后跳出错误(如下所示)。请问是什么原因?我应该如何操作才能看到正确的信息报告呢?谢谢。

附出错信息如下:

REST Version: 1.7, Release: 20120101
This report is based on CUI Xu's xjview. (http://www.alivelearn.net/xjview/)
Revised by YAN Chao-Gan and ZHU Wei-Xuan 20091108: suitable for different Cluster Connectivity Criterion: surface connected, edge connected, corner connected.
Number of clusters found: 4