DPABI/DPABISurf/DPARSF

Questions about Repeated Measures ANOVA

Submitted by Fuzzzz on

Dear Prof Yan

I have some questions about statistical analysis.

In our study, all patients were assigned to three groups, with two different medication treatment and one medication-naive control. And all these patients accepted MRI scan at baseline and after 12 weeks. Now, my question is as followings:

1. Can we compare the group × time interaction effects on brain activity indicators by repeated measures ANOVA, such as ALFF,fALFF and ReHo. At first, I try to do this by mixed-effects comparison, but it can only treat two factors.

ROI timecourse

Submitted by 18483620297 on

          尊敬的专家:

                    您好,我通过dpabi中的Extract ROI courses 对AAL、哈佛牛津地图、CC200等4个地图集进行了ROI区域时间序列提取,我想知道的是dpabi在提取ROI时间序列的时候,是通过什么样的计算方式。是分别对每个ROI区域内进行标准化后输出吗?(减均值/标准差),还是通过其他方式?第二个问题,如图所示,ROI Signals_Sub_XX.mat 是每个ROI区域的时间序列吗?   在视频中我并没有看到这一点的讲解,我对ROI提取十分感兴趣,期待您的答复!

        祝您工作愉快!

Group ICA

Submitted by 18483620297 on

           尊敬的专家:

                           您好,我有一个很愚昧的问题需要请教。在做Group ICA分析正常人与病人的时候,我们应该将正常人和病人分别作为一组进行Group ICA,还是应该将正常人与病人都放在一起然后进行Group ICA?

                 

关于头动排除指标的疑问

Submitted by Czh on

尊敬的严老师您好:

       我目前参与分析的两组被试中,第一组有114例,第二组19例,扫描时voxel为4x4x4,我若将排除头动的标准由3mm/3 degree+FD>0.2升高至4mm/4 degree+FD>0.2,第二组可增加3例被试,这样的排除头动标准审稿人会接受吗?

      感谢严老师

 

DAPBISurf 使用问题请教

Submitted by ly666 on

各位老师好,

        最近正在学习DPABISurf的使用,也研究了fmriprep。相比于官方的fmriprep,DPABISurf提供了更好的交互界面(用户体验),以及后续的一系列处理,如regress out nuisance, smoothing,filtering ..., 十分方便,感谢DPABI团队提供如此优秀的工具包。在使用的过程中我也遇到了一些问题,希望各位老师指教。

       1) 关于fmriprep提供的volume空间分辨率只有1m, 2m 和 native, 如果想要配准到3m*3m*3m标准空间怎么办?(数据的原始分辨率比较大,2m会增加计算负担,且可能信息冗余)。如果可以直接resample的话,我应该先配准到哪个分辨率(1m,2m 或者 native)?如果我的处理步骤是FunVoluWCSF的话,我应该把resample放在哪步之后比较好?